1867年，根据明治天皇敕令在日本东北地区仙台设置一所国立大学，定名为东北帝国大学，它是继东京大学、京都大学之后日本第三个国立大学。当时大学采用分科建制，东北帝国大学只有一个农科大学（后来农科大学独立为北海道农业大学），数年后又增设了理科大学，其校址就在现今的片平本部校区，东北帝大校长由农科大学校长兼任，经费来源有古柯虑之助及宫城县、北海道方面捐赠。1917年增设医科大学。四年后各分科大学改为学部，并相继设立工学部、法文学部，学校有了可观的规模。二次大战后实行新制，法文学部分为法学部、文学部、经济学部，第二高等学校、仙台工业专科学校、宫城师范学校、宫城青年师范学校及宫城女子专门学校相继并入，新设立了教育学部，校名改为东北大学。以后数年，牙科学部、药学部、教育学部先后成立，研究生院设置了有关各科，一大批研究所、全校共同利用的研究设施也相继出现，现已成为包括文、理、工、医、农各科，规模巨大的综合性国立大学。

东北大学目前的机构和组织如下：

学术结构：东北大学现有文学部、教育学部、法学部、经济学部、理学部、工学部、医学部、药学部和牙科学部等10个学部、379个讲座或学科目。研究生院设有文学、教育学、法学、经济学、理学、工学、医学、药学、牙科学、农学10个研究科。全校有金属材料、选矿冶炼、抗霉菌病、科学计算、高速力学、电气通讯、非水溶液化学7个附属研究所，还有遗传学研究中心、大型计算中心等两个全国共同利用设施。全校共同利用机构有：低温中心、应用情报学研究中心、情报处理教育中心，遗传实验室，环境保护中心，计算中心，百万伏电子显微镜室和保健管理中心等。

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